Múzeum sa objaví na ulici Valovaya neďaleko kanálu Raduni - v malebnom a nepreľudnenom kúte Starého Mesta. Toto miesto je mimoriadne významné pre poľskú aj európsku históriu. Blízko predvojnového obdobia, keď Gdansk niesol názov „Slobodné mesto Danzig“a bol neutrálnym územím pod kontrolou Spoločnosti národov, je poľská pošta. V medzivojnovom období to bola jedna z dvoch poľských štátnych inštitúcií v meste (druhou bol Vojenský tranzitný sklad na polostrove Westerplatte). Preto sa pošta 1. septembra 1939, v prvý deň druhej svetovej vojny, stala jedným z hlavných cieľov nacistických vojsk a napriek hrdinskému odporu zamestnancov pošty (niektorí z nich zahynuli v bitke alebo neskôr) zomrel na rany, zvyšok popravili nacisti), bol nimi zajatý. Teraz je v budove spolu s poštou múzeum a neďaleké námestie je pomenované po obrancoch poľskej pošty. Múzeum druhej svetovej vojny, ktoré je naplánované otvoriť v roku 2014, roku 75. výročia jej začiatku, doplní toto pamätné miesto.
O tom, ktorý projekt múzea si zaslúži realizáciu, rozhodli predseda poroty, viceprimátor Gdansku Wieslaw Bielawski, poľskí architekti Grzegorz Bucek, Wieslaw Chabanski a Wieslaw Gruszkowski, zástupcovia medzinárodnej architektonickej komunity Daniel Libeskind, Hans Stiman a George Ferguson, ako aj historik Wojciech Duda, riaditeľ Múzea v Londýne, britského poľského pôvodu Jack Lohman a dizajnér Andrzej Pongowski. Členovia poroty hodnotili spolu 240 projektov z 33 krajín.
Ceny boli udelené siedmim účastníkom, ktorí si rozdelili cenový fond vo výške 200-tisíc eur. Tri hlavné ceny si prevzala kancelária Kwadrat (jej projekt sa bude realizovať), poľský workshop Piotr Płaskowicki & partnerzy a grécki architekti Betaplan. Peňažné ceny dostali aj bulharské, turecké a dve poľské kancelárie.
Na jar 2010 zverejnila oficiálna webová stránka budúceho múzea výzvu Donalda Tuska na konkurenčných architektov. Poľský premiér navrhol, že „koncepcia múzea a jeho ďalší vývoj bude vo veľkej miere závisieť od architektonickej formy“. A tak sa aj stalo: vedúcemu ateliéru Kwadrat Jacekovi Droszczovi sa skutočne podarilo čiastočne predurčiť rozhodnutie múzejnej expozície v jeho tvorbe. V rozhovore pre poľské noviny Gazeta Wyborcza Trojmiasto hovoril o symbolike svojej verzie múzea: budúci návštevníci si prezrú expozíciu, počnúc podzemnou časťou („je to ako peklo vyvolané vojnou“) a končiac veža s výhľadom na panorámu obnoveného mesta Gdansk. Čas a priestor sú tu základné kategórie. Strašidelné cestovanie v čase sa začína v žalári; návštevník múzea sa vracia k modernosti až po vystúpení na úroveň terénu. Veža na konci výstavy symbolizuje budúcnosť nahradzujúcu minulosť a prítomnosť.
Porota poznamenala, že budova navrhnutá štúdiom Kwadrat dáva návštevníkovi pocítiť hrôzu vojny, ale zároveň mu neuberá nádej na budúcnosť. Zložitá téma je podľa odborníkov zverejnená správne. Hodnota budovy sa zvyšuje vďaka jej všestrannosti; veža múzea je teda úplne konštruktívnym vynálezom: stane sa z nej nádherná vyhliadková plošina. Priestor múzea nebol vytvorený len na to, aby hovoril o minulosti, ale aby sa stal miestom odpočinku obyvateľov a hostí moderného Gdansku.
Je zaujímavé poznamenať, že samotná skutočnosť výstavby múzea bola spočiatku posudzovaná nejednoznačne. Napríklad zástupca regionálnej ochrany pamiatok Marian Kwapiński vyjadril obavy z ochrany historickej zóny mesta, úspešný projekt však dokázal rozptýliť všetky pochybnosti.
Architekti vicemajstra Piotr Plaskowicki & partnerzy uviedli, že ich múzeum je skôr „anti-budovou“. Podľa ich projektu je na brehu prieplavu mohutná tmavočervená stena s ostrými zubami na vrchu, vedľa je s ňou kontrastný rovnobežnostenný pavilón. Tieto dva prvky sú od seba oddelené krytým priestorom - chodníkom pre chodcov. Tento projekt nie je o nič menej symbolický ako víťaz prvého miesta. Porota v ňom videla pretočenie historických období - vojenských i moderných, príbeh ničenia a obrodenia.
Myšlienka dielne Betaplan je založená na obdĺžniku rozdelenom na niekoľko fragmentov. Vyrobili nový tvar a umiestnili časti pôvodného obdĺžnika v náhodnom poradí do vzájomnej vzdialenosti. Výsledkom sú budovy spojené spoločným presahom, ktoré vytvárajú platformu: návštevníci na ňu môžu vyliezť. Múzeum gréckeho úradu porota vysoko ocenila za to, že sa jeho autorom podarilo „precítiť“Gdansk a budovu úspešne zapadnúť do panorámy mesta. Ukázalo sa to však nedostatočné, pretože táto možnosť sa dostala iba do mestského rozsahu a organizátori chcú, aby sa z budúceho múzea stala skutočne národná a dokonca celoeurópska inštitúcia.
Podľa denníka Gazeta Wyborcza Trojmiasto bolo 4. januára 2011 prijaté uznesenie o financovaní projektu Múzea druhej svetovej vojny. Na jeho výstavbu a usporiadanie sa použije 358 miliónov zlotých (asi 120 miliónov dolárov). Dnes je múzeum považované za prioritnú budovu: to znamená, že aj v zložitom pokrízovom období mu bude venovaná prednostná pozornosť, pretože múzeum venované vojne bude stále spojené s akýmkoľvek spôsobom prekonávaním prekážok a obrodením.
