Budova bude umiestnená na brehu úžiny Øresund, obklopená umelými vodnými nádržami. Z hľadiska neho pripomína vírivku, ktorá je nielen formálnym zariadením, ale nesie aj funkčné zaťaženie - v každom z „ramien“bude samostatná výstavná plocha venovaná jednému z oceánov. Ak sa v budúcnosti akvárium rozhodne rozšíriť, potom je možné ľubovoľné z týchto telies predĺžiť s minimálnymi nákladmi; počas procesu výstavby bude múzeum fungovať ako obvykle.
V strede budovy sa nachádza „okrúhla miestnosť“, v ktorej sa otvárajú všetky hlavné miestnosti vrátane vstupnej haly, ktorej podlahy sú priehľadným dnom bazéna.